Dirección
Es un órgano de representación y conducción política del Centro que por delegación del Consejo Directivo, con quien tiene relación directa y permanente, asume la responsabilidad de organizar y orientar la intervención institucional, mediante la animación y coordinación colegiada. Su responsabilidad es orientar y ejecutar la realización del proyecto y, en conjunto con el equipo del Centro, lograr el cumplimiento de los objetivos, misión y directrices del Consejo Directivo.
Área de Trabajo Regional
Con el fin de posibilitar que las estrategias de defensa social y fortalecimiento a procesos sociales atendiendo las denuncias encaminadas a prevenir o cesar de manera inmediata posibles violaciones a los derechos humanos que pongan en riesgo la vida, la integridad física o daños irreparables a individuos o grupos, a través de gestiones administrativas, políticas o judiciales pertinentes a cada caso. Realizan el análisis territorial permanente del movimiento social chiapaneco y de sus actores relevantes así como la investigación y documentación en campo de violaciones a derechos humanos. Acompañamiento a procesos organizativos de defensa integral social y de ejercicio de derechos y coordinación, con los actores regionales, el acompañamiento de observadores en comunidades en riesgo de sufrir agresiones y violaciones a derechos humanos a causa del conflicto armado no resuelto.
Área de Sistematización e Incidencia Social
Es el Área que se encarga de ordenar e interpretar la información sobre derechos humanos generada por el Centro y otras fuentes pertinentes. Facilita el monitoreo para el análisis de la situación de los derechos humanos en Chiapas y el conflicto armado interno no resuelto, para poder denunciar patrones, tendencias, que mejoren la intervención del Centro con los procesos sociales. Es la responsable de mantener activa la vinculación con redes y plataformas de solidaridad. Asimismo, con toda la información procesada es la encargada de operar la estrategia de comunicación social del Centro. El objetivo fundamental es mantener visible la imagen, la acción, la misión y la visión del Centro para el fortalecimiento de actores sociales organizados en torno a la defensa, demanda y ejercicio de derechos; generar opinión pública, difundiendo y denunciando en los ámbitos local, nacional e internacional, violaciones a derechos humanos y aportes de los pueblos a las prácticas de ejercicio de derechos: casos, situaciones, procesos, patrones sistemáticos y problemas estructurales.
Área de Planeación, Monitoreo, Evaluación y Procuración de Fondos
Es el área responsable de apoyar al equipo de conducción y de áreas en el desarrollo del sistema de planeación, monitoreo y evaluación del Centro. El objetivo de ésta es instalar el sistema de PME, con base a las necesidades y planteamientos institucionales que permitan potenciar nuestro quehacer y recuperar con mejores instrumentos los impactos sociales de nuestra acción. En principio esta área tiene una temporalidad delimitada de dos años.
Área de Administración y Contabilidad
Es el área cuya responsabilidad es prever, organizar y coordinar el uso y optimización de los recursos materiales y financieros para contribuir al desarrollo institucional, los objetivos del Centro, con base a las directrices planteadas por la Dirección y la implementación del proyecto.
Equipo de Conducción
Es una instancia de conducción colegiada donde se toman las decisiones de carácter directivo, para orientar y facilitar al equipo el desarrollo del Proyecto, a partir de la construcción de decisiones relacionadas con la conducción política del Centro, de la visión y el posicionamiento institucional, y del funcionamiento eficiente de la institución que den viabilidad al Proyecto institucional. Se compone de la Dirección y las Coordinaciones de Área.